在七千五百万年至一百万年以前，通称第三纪的漫长地质时期内，基础的石灰岩是作为风成堆积物而奠定的。这种堆积物经过逐渐的几乎是极细微的积累过程，形成了一个四周环海的高地，又由于海浪侵蚀而变成岛屿，并且被大峡谷所割裂开来—如佛罗里达海峡、普罗维登斯海峡、舌形海峡(TongueoftheOcean)以及克鲁克德岛海峡等。表层的起伏和不高的山丘可能是在飓风袭击时期沙丘建造的结果。然而，巴哈马群岛目前地形的许多特点，都是在地质上的晚期，即在四个冰期和间冰期，由于珊瑚建造所产生的。

实际上，巴哈马群岛是名副其实的珊瑚群岛。外层石灰岩让海水浸蚀得如刀刃般锋利，在内地则成蜂窝状的壶穴和岩洞，这种岩石，直到其很深之处都含有珊瑚形骸的化石。这个群岛的气候和海水，很适宜于珊瑚的建造，阳光充足，而且毫无冲积作用。水温从不低于珊瑚的最低温度即七十度，几乎总在七十五至八十五度的理想幅度之内。洋流替饥饿的珊瑚带来了必需的食物，盐分是在千分之二十五至四十的理想幅度之间，而且在大片的浅水区里，海水竟浅于珊瑚所适应的最大深度，即一百五十尺。